un infekcijas izplatīšanās veidi var būt dažādi. Patogēnu izraisītā kolonizācija faktiski var notikt, izmantojot:
- Augšupceļš no urīnpūšļa (visbiežāk): no starpenes (vai no maksts priekšnama, sievietēm) mikroorganismi iet uz augšu urīnizvadkanālā, pēc tam urīnpūslī, līdz nierēm; galvenie cēloņi sieviešu infekciju veido urīnizvadkanāla deformācija dzimumakta laikā, savukārt vīriešiem tā bieži ir sekundāra prostatīta dēļ. Kateterizētiem pacientiem pēc katetra novietošanas vai manipulācijas var rasties piesārņojums, kā rezultātā patogēni var iekļūt urīnpūslī .
- Asins lejupejošs ceļš: caur asinsriti septicēmijas laikā patogēni nonāk nierēs, izraisot nefrītu un nieru abscesus.
- Dilstošs limfātiskais ceļš: limfas asinsvadu tīkls savieno augšupejošo resnās zarnas ar labo nieru un lejupejošo resnās zarnas ar kreiso nieru.
Pielonefrīta izraisītie mikroorganismi parasti ir vienādi atbildīgi par urīnceļu, dzimumorgānu un kuņģa -zarnu trakta infekcijām, tāpēc urīnpūslī, prostatā, dzemdes kaklā, maksts, urīnizvadkanālā vai taisnās zarnās: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterococcus spp. utt.
Vairumā gadījumu šie patogēni pārstāv fekāliju floras baktērijas, kuras iet augšupejošā ceļā, lai gan kopumā peristaltika (kontrakciju kustības un urīnceļu sieniņu izplešanās) veic "efektīvu aizsargājošu darbību pret infekcijām.
Dažkārt tiek ziņots par citiem neparastiem mikroorganismiem: mikobaktērijām, raugiem un sēnītēm, kā arī oportūnistiskiem patogēniem, piemēram, Corynebacterium urealyticum.