Nukleīnskābe ir ievietota sava veida traukā vai pārklājumā, ko sauc par kapsīdu un sastāv no atkārtotām olbaltumvielu apakšvienībām, kapsomēri, savukārt veidojas, atkārtojot vienu, divus vai vairākus proteīnus. Piemēram, papilomas vīrusa gadījumā kapsīds sastāv no vairākām divu dažādu olbaltumvielu - L1 un L2 - kopijām; pirmajam, bagātīgākam, ir iespēja pašapkopoties un veidot virionus bez nukleīnskābēm (tas ir ļoti imūnogēns, un tāpēc to izmanto par pamatu vakcīnu ražošanai).
The kodols garantē vīrusam spēju veikt vairošanās un augšanas procesus, savukārt kapsīds piešķir vīrusa daļiņai formu un stabilitāti, aizsargā tā genomu un ir svarīgs infekciozitātei (pateicoties antireceptoru struktūru klātbūtnei).
Kopā kapsīds un nukleīnskābe veido nukleokapsīds.
Dabā ir vīrusi, ko veido tikai nukleīnskābes un kapsīds, un tāpēc to sauc par "kaili vīrusi"; bakteriofāgi ir neapbruņotu vīrusu piemērs. Ir arī citas vīrusu daļiņas, kas papildus kapsīdam satur ārējo membrānu, ko sauc par perikapsīdu, peplos vai apmetnis (aploksne), kas izriet no saimniekšūnas plazmas membrānas un kā tāds sastāv galvenokārt no fosfolipīdiem, bet arī no polisaharīdiem un olbaltumvielām (parasti glikoproteīniem). Vīrusi ar perikapsīdu tiek saukti par "pārklāts ar vīrusu"un parasti tiem ir arī olbaltumvielu struktūra, ko sauc par matricu vai integritāti, kas atrodas starp kapsīdu un perikapsīdu.
Pārklāti vīrusi - pateicoties perikapsīda fosfolipīdiem - vieglāk iekļūst uzņēmīgās šūnās un samazina saimnieka imūnreakciju; adenovīruss, kas ir atbildīgs par konjunktivītu un paragripas simptomiem, ir pārklāta vīrusa piemērs, tāpat kā visi citi vīrusi. Vīrusi, kas inficē eikariotus.
Vīrusu kapsīds parasti var uzņemties divas dažādas konformācijas, kurām raksturīga viena ikosaedriskā tipa uzbūve vai spirālveida.
Ikosaedrs ir ciets materiāls, ko veido vienādmalu trīsstūri, kuram ir 12 virsotnes, 20 sejas, kas sastāv no vienādmalu trijstūriem, un 30 malas, kas atbilst trijstūra malām, bet virsotnes ir malu satikšanās punkti. Šī kristalogrāfiskā struktūra izriet no savienība regulē vairāk olbaltumvielu; katru no tiem sauc par monomēru, un šie monomēri var apvienoties no pieciem līdz pieciem, veidojot pentonus, vai - lielākos vīrusos - no 6 līdz 6, veidojot tā sauktos eksonus. Pentonu un eksonu asociācija veido eikozaedru, kurā atrodas ģenētiskais materiāls.
Otrajā kapsīda strukturālajā tipoloģijā, ko sauc par spirālveida, atsevišķi monomēri ir izvietoti spirālē ap asi (olbaltumvielas ir sakārtotas kā spirālveida kāpņu pakāpieni), veidojot dobu cilindru, kas aptver nukleīnskābi.
Tabakas mozaīkas vīruss ir tipisks spirālveida struktūras vīrusa piemērs, savukārt papilomas vīrusam ir ikozahedra struktūra. Ir arī vīrusi, kuros kapsīdam trūkst simetrijas un kuriem ir jaukta morfoloģija (piemēram, HIV vīruss, kas sastāv no ikozahedrālā kapsīda un pavedienveida nukleīnskābes kodola).
Vīrusu klasifikācija
Katru vīrusu identificē suga, ģints un ģimene. Piemēram, ja mēs lietojam HIV vīrusu, suga norāda mikrogrānisma vispārīgo nosaukumu, tas ir, iegūto imūndeficīta vīrusu vai, tieši, HIV. Šis vīruss pieder lentivīrusu ģintij (ti, ar lēnu augšanas ciklu) un retrovirīdiem ģimene (retrovīrusi ir vīrusi ar replikācijas ciklu, kam raksturīgas divas nukleīnskābes formas, kuras satur fermentu, ko sauc par reverso transkriptāzi, kas spēj veikt reverso transkripciju, pārveidojot vīrusa RNS DNS).
Pēc tam katra vīrusu suga tiek aprakstīta, pamatojoties uz struktūru (nukleīnskābes lielums, morfoloģija un veids), replikācijas veidu (kodola vai citoplazmas), saimniekšūnu (dzīvnieki, sēnītes, augi vai baktērijas), audu tropismu vai orgāns un transmisijas veids (fekāli-orāli, parenterāli utt.).
Pretvīrusu vakcīnas
Pretvīrusu vakcīnas var sastāvēt no nogalinātiem (inaktivētiem), novājinātiem vīrusiem (tie ir saglabājuši spēju vairoties, bet ir zaudējuši lielu daļu patogēnā potenciāla) vai no vīrusu apakšvienībām (jaunas paaudzes vakcīnas tiek veidotas, piemēram, no vīrusu perikapsīda proteīniem, spēj stimulēt pasīvo imunitāti.) Jaunās paaudzes preparāts ir B hepatīta vakcīna, kuras pamatā ir tikai HBV vīrusa kapsīda glikoproeīns.
Citi raksti par tēmu "Vīrusu struktūra un klasifikācija"
- Vīruss
- Vīrusu pavairošana
- Slimības, ko izraisa vīrusi un pretvīrusu zāles